Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms