Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q6P435 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q6P435 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q6P435 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q6P435 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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