Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms