Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms