Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms