Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms