Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00303Q3SY05 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00303Q3SY05 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms