Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms