Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms