Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISXQ2M1V0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms