Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL24A1Q17RW2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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