Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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