Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms