Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms