Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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