Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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