Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CNGA3Q16281 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CNGA3Q16281 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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CNGA3Q16281 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CNGA3Q16281 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CNGA3Q16281 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CNGA3Q16281 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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