Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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