Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
USF2Q15853 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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