Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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VAMP3Q15836 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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VAMP3Q15836 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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