Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF13Q15543 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF13Q15543 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms