Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSME4Q14997 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSME4Q14997 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms