Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms