Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSPNQ14714 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms