Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMC1AQ14683 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms