Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IHHQ14623 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IHHQ14623 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IHHQ14623 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IHHQ14623 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms