Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASGRF1Q13972 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms