Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATRQ13535 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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