Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCIRG1Q13488 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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