Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD4Q13485 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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