Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TOP3AQ13472 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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