Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms