Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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