Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SKP2Q13309 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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