Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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