Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK2Q13002 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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