Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms