Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE4DQ08499 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE4DQ08499 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms