Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX1T1Q06455 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms