Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms