Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NOTCH2Q04721 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms