Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms