Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF85Q03923 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF85Q03923 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms