Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC6Q03468 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC6Q03468 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms