Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms