Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 LINC02246-207ENST00000630354 524 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 DLEU1-201ENST00000378180 981 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MTND4P30-201ENST00000450281 899 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MITD1-201ENST00000289359 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms