Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms