Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MC1RQ01726 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms