Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms