Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms